特別天然記念物と言うのは、文化財保護法第109条第2項の規定により、天然記念物の中でも、世界的に又は国家的に価値が特に高いものとして特別に指定されたもののことをいいます。
特別天然記念物を英語でいうと Special natural monument（スペシャル ナチュラル モニュメント）といいます。
天然記念物とは、動物、植物、地質・鉱物などの自然物に関する記念物のことで、日本では、文化財保護法や各地方自治体の文化財保護条例に基づいて国によって天然記念物を指定します。また、天然保護区域というのは天然記念物を含んだ一定の範囲のことをいいます。
国が指定する天然記念物は「文化財保護法」（1950年制定）に基づいて、文部科学大臣が指定します。
天然記念物の指定対象
指定の対象となるのは以下の7種類となります。
- 動物
- 植物
- 地質鉱物
- 天然保護区域
- 動物の生息地、繁殖地、渡来地
- 植物の自生地
- 鉱物の特異な自然現象を生じている土地や地域
2017年現在、1,025件の天然記念物が指定されていて、このうち75件が特別天然記念物に指定されています。
動物の特別天然記念物 21件
- カモシカ
- カワウソ
- イリオモテヤマネコ
- アマミノクロウサギ
- トキ
- コウノトリ
- タンチョウ
- アホウドリ
- カンムリワシ
- ライチョウ
- ノグチゲラ
- メグロ
- オオサンショウウオ
- 土佐のオナガドリ
- 小湊のハクチョウおよびその渡来地 : 青森県
- 鯛の浦タイ生息地 : 千葉県
- ホタルイカ群遊海面 : 富山県
- 長岡のゲンジボタルおよびその発生地 : 滋賀県
- 八代のツルおよびその渡来地 : 山口県
- 高知市のミカドアゲハおよびその生息地 : 高知県
- 鹿児島県のツルおよびその渡来地 : 鹿児島県
植物の特別天然記念物 30件
- 阿寒湖のマリモ : 北海道
- 野幌原始林 : 北海道
- アポイ岳高山植物群落 : 北海道
- 早池峰山および薬師岳の高山帯・森林植物群落 : 岩手県
- 羽黒山のスギ並木 : 山形県
- 東根の大ケヤキ : 山形県
- コウシンソウ自生地 : 栃木県
- 日光杉並木街道 附 並木寄進碑 : 栃木県
- 田島ヶ原サクラソウ自生地 : 埼玉県
- 牛島のフジ : 埼玉県
- 大島のサクラ株 : 東京都
- 白馬連山高山植物帯 : 長野県・新潟県・富山県
- 狩宿の下馬ザクラ : 静岡県
- 石徹白のスギ : 岐阜県
- 春日山原始林 : 奈良県
- 大山のダイセンキャラボク純林 : 鳥取県
- 加茂の大クス: 徳島県
- 宝生院のシンパク : 香川県
- 杉の大スギ : 高知県
- 古処山ツゲ原始林 : 福岡県
- 立花山クスノキ原始林 : 福岡県
- 相良のアイラトビカズラ : 熊本県
- 青島亜熱帯性植物群落 : 宮崎県
- 都井岬ソテツ自生地 : 宮崎県
- 内海のヤッコソウ発生地 : 宮崎県
- 喜入のリュウキュウコウガイ産地 : 鹿児島県
- 枇榔島亜熱帯性植物群落 : 鹿児島県
- 蒲生のクス : 鹿児島県
- 鹿児島県のソテツ自生地 : 鹿児島県
- 屋久島スギ原始林 : 鹿児島県
地質・鉱物の特別天然記念物 20件
- 昭和新山：北海道
- 夏油温泉の石灰華 : 岩手県
- 焼走り熔岩流 : 岩手県
- 根反の大珪化木 : 岩手県
- 玉川温泉の北投石 : 秋田県
- 鬼首の雌釜および雄釜間歇温泉 : 宮城県
- 浅間山熔岩樹型 : 群馬県
- 御岳の鏡岩 : 埼玉県
- 魚津埋没林 : 富山県
- 薬師岳の圏谷群：富山県
- 岩間の噴泉塔群：石川県
- 鳴沢熔岩樹型 : 山梨県
- 白骨温泉の噴湯丘と球状石灰石 : 長野県
- 根尾谷断層 : 岐阜県
- 根尾谷の菊花石 : 岐阜県
- 湧玉池 : 静岡県
- 大根島の熔岩隧道 : 島根県
- 秋芳洞 : 山口県
- 秋吉台 : 山口県
- 八釜の甌穴群 : 愛媛県
天然保護区域の特別天然記念物 4件
- 大雪山 : 北海道
- 尾瀬 : 福島県・群馬県・新潟県
- 黒部峡谷附猿飛ならびに奥鐘山 : 富山県
- 上高地 : 長野県
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